Не смотря на благоприятные изменения во внутриполитическом и внешнеполитическом курсе страны, которые проводились и принимались во время Перестройки, в СССР наблюдались обострения, которые в последствие проявились в межнациональных конфликтах. Стоит отметить, что огромное количество подобных инцидентов стали одной из причин, приведших к развалу Союза в 1991г.
Межнациональные конфликты возникали по мере ослабления центрального руководства. Таким образом в 1986г. в феврале произошла драка в Якутии. В декабре того же года - в Алматы. С лета 1987г. выступления стали носить не единичный или случайный, а массовый организованный характер.
В конце февраля 1988г. образовалось движение за воссоединение Нагорного Карабаха с Арменией.
В 1989г. случился конфликт между узбеками и турками-месхетинцами в Ферегане.
Начало 1990г. обозначилось погромами армян в Баку.
Весна-осень 1988г. оформились национальные фронты в Прибалтике.
В 1989г. - движения в Грузии за выход из СССР.
В 1990г. – массовые движения в Молдавии.
В 1990г. Литва провозгласила независимость. Позже, следуя ее примеру, об этом заявили Латвия и Эстония.
Подобные настроения, движения и события требовали реорганизации советской власти.