В 1930-е гг. происходит ужесточения режима и осуществляется репрессии. В эти годы комсомол Беларуси также затронули массовые политические репрессии. Репрессии привели к тому, что в 1937—38 годах актив ЛКСМБ почти полностью обновился. Тем не менее, количество комсомольцев продолжало расти. В конце 1940 года в ЛКСМБ насчитывалось 263 749 человек, которые были объединены в 15 163 организации. Накануне Великой Отечественной войны в центре внимания комсомола были вопросы военно-патриотического воспитания молодёжи. Комсомол проводил подготовку молодежи по противовоздушной, химической и санитарной обороне. За 1939—40 годы в Беларуси подготовлено 753 478 значкистов противовоздушной, химической и санитарной обороны, 6350 пулемётчиков, 500 снайперов. В 1940 году оборонные значки были у 62% призывников.
С началом войны, ЦК ЛКСМБ объявил комсомол мобилизованным на борьбу с немецко-фашистскими захватчиками. Только к августу 1941 года добровольно и по мобилизации в Красную Армию пошло более 103 тыс. комсомольцев. Деятельность комсомола продолжалась и в тылу врага. Там действовало 10 областных, 214 городских, районных и межрайонных комитетов ЛКСМБ, 2500 первичных организаций в партизанских формированиях, около 3 тысяч комсомольских и 335 молодёжных организаций и групп в подполье. Также, интересен и тот факт, что 52% состава партизанских формирований — комсомольцы и молодёжь в возрасте до 30 лет . За годы Великой Отечественной войны звание Героя Советского Союза получили около 300 комсомольцев-воинов, партизан и подпольщиков. В 1945 году ЛКСМБ награждён орденом Красного Знамени (за мужество, самоотверженность и героизм, проявленные комсомольцами и молодёжью Беларуси в рядах Красной армии и партизанских отрядах, в борьбе с немецко-фашистскими захватчиками).