В водной среде ведущая роль с абиотических факторов принадлежит температуре, освещенности, давления, газовому составу и солености воды, рельефа дна и тому подобное.
Освещенность водоемов быстро уменьшается с увеличением глубины, поэтому глубоководные животные даже с хорошо развитыми органами зрения (головоногие моллюски, рыбы, китообразные) видят только на незначительном расстоянии. Для общения, ориентации в пространстве, поиска пищи они используют звуковые, световые и другие способы передачи и восприятия информации.
Колебания температуры в воде значительно меньше, в отличие от воздуха.
Водоемы различных типов отличаются по солевому составу воды: одни виды способны существовать только в пресных водоемах (карась, карп, щука), другие - только в соленых (акулы, киты), рачок артемия живет в пресных и соленых водоемах.
Передвижения водных масс обусловленные положением Земли относительно Солнца и луны (приливы и отливы), земным притяжением (течение рек), влиянием ветра и т. Д, поэтому виды приточно-отливной зоны имеют специальные приспособления: во время отлива закапываются в песок, прячутся в ракушках , домиках (моллюски, усоногие раки), мигрируют в море (медузы).