Підземні пагони завжди видозмінені у зв'язку з накопиченням поживних речовин, що використовуються для переживання несприятливих сезонів, або з швидким поширенням на нових територіях , виникають видозміни пагона в цілому або окремих його частин (стебла чи листків).
Типовий пагін — це надземний орган, тому будь-який пагін, який знаходиться у ґрунті, буде видозміненим. Підземними видозміненими пагонами є кореневище, бульба, цибулина, бульбоцибулина.
Кореневище — підземний пагін із тривалим верхівковим наростанням, стебло виконує запасаючу функцію, а листки зазвичай перетворені на захисні луски. Кореневища із сильно видовженими міжвузлями сприяють швидкому поширенню рослини на нових ділянках ґрунту (анемона дібровна, пирій), з короткими міжвузлями (у півників) виконують виключно запасаючу функцію.
Бульба - підземний пагін з обмеженим верхівковим ростом та сильно потовщеним стебло, в якому запасаються поживні речовини, листки дрібні лускоподібні або утворюють невисокі валики («брівки»), у пазухах яких розташовані пазушні бруньки («вічка») (картопля).
Цибулина — підземний пагін із тривалим або обмеженим верхівковим ростом, стебло якого — «денце» — сильно вкорочене, не м'ясисте, а листки видозмінені у соковиті луски, що виконують функцію запасання поживних речовин (лілія, тюльпан, цибуля городня).
Бульбоцибулини— це вкорочені підземні пагони з обмеженим наростанням, які за формою нагадують цибулини, але їх м'ясисте і потовщене стебло запасає поживні речовини, а листки видозмінені в сухі плівчасті луски (гладіолус, шафран).