Инфузории — наиболее сложно устроенные простейшие. Тело инфузорий покрыто плотной оболочкой, что сохраняет им постоянную форму. Характерными признаками класса инфузорий являются волосовидные выросты цитоплазмы — реснички — органоиды движения. Около рта реснички, в связи с функцией захвата пищи, нередко становятся более мощными, длинными и даже склеиваются по нескольку вместе в прозрачные пластинки. Тело делится на наружный слой и внутреннюю часть — эндоплазму.
Вторым важным отличительным признаком инфузорий является присутствие в их теле по меньшей мере двух ядер, и притом различных по своим свойствам. Одно из них всегда значительно крупнее другого. Крупное ядро контролирует обмен веществ и движение. Малое ядро играет главную роль в размножении.
У всех инфузорий происходит усложнение пищеварительной системы. На передней части находится ротовое отверстие, которое ведет в глубокий канал — глотку. На дне глотки образуется маленькая пищеварительная вакуоль. Наполнившись пищей, вакуоль отрывается от глотки и увлекается током эндоплазмы, описывая в теле животного определенный путь. Оставшиеся внутри вакуоли непереваренные остатки пищи выталкиваются вместе с ней через особое, находящееся неподалеку от заднего конца тела отверстие — порошицу. Пищеварительные вакуоли образуются на дне глотки через каждые 1,5 — 2 минуты.
Жидкие продукты выделения, удаляются, через 2 пульсирующие вакуоли. Они имеют довольно сложное строение. Типично этот органоид состоит из собственно вакуоли, окруженной венчиком приводящих каналов. Кроме того, вакуоль при помощи тонкого выводного канальца сообщается с наружной средой. Вакуоли выполняют не только выделительную, но и функцию регуляции внутреннего давления.
Раздражимость у инфузорий обеспечивается специальными осязательными ресничками. У некоторых паразитических инфузорий обнаружено нечто вроде примитивных органов чувства равновесия — пузырек, прикрытый утолщенной оболочкой и содержащий в себе кучку кристаллических выделительных телец .
При неблагоприятных условиях инфузории образуют цисты. Среди многообразия паразитических форм единственным представителем имеющим медицинское значение является балантидий кишечный.