Местные сибирские племена постепенно входили в состав Российского государства. Происходило это, как правило, мирным путем, хотя бывали и военные столкновения между местными жителями и русскими первопроходцами. Самое главное, что ни один из народов Сибири не был стёрт с лица земли, как это случалось, например, во время завоевания европейцами Американского континента, В правовом отношении они не были ущемлены по сравнению с другими народами России, в том числе с русскими. Сибирские народы должны были ежегодно платить в казну ясак, то есть подать мехами, в основном собольими, но также беличьими, лисьими и другими. Ясак приносил большие богатства Российскому государству. Правительство понимало, как важно сохранять добрые отношения с местными народами. Поэтому от сибирских воевод и служилых людей требовалось «ясак имать ласкою, а не жесточью». не обременять население непосильными поборами. Для управления Сибирью в 1637 году был учреждён Сибирский приказ. В самой Сибири центром власти был основанный ещё в XVI веке город Тобольск. Сибирь считалась «государевой вотчиной», поэтому на её территории не было ни частного землевладения, ни крепостного права. Освоение Сибири привело не только к использованию её природных богатств, но и к хозяйственному развитию края.
На юге Сибири расирос гранилось пашенное земледелие. Из переселенцев сложилось сибирское крестьянство, которое уже к концу XVII века обеспечивало хлебом всю Сибирь.